如何使用Flex平台完成NGS文库建库全过程?

下一代测序(NGS)技术已经成为生命科学研究和临床诊断的重要工具,而文库建库作为NGS流程中的关键环节,直接影响测序质量和结果可靠性。传统手工建库操作繁琐且易出错,自动化平台成为提升效率和准确性的必然选择。Opentrons的Flex平台以其高精度和灵活性,助力实验室实现NGS文库建库全过程自动化。
本文将详细介绍如何使用Flex平台完成从样本准备到最终文库生成的完整流程,帮助您高效、精准地完成NGS建库任务。

如何使用Flex平台完成NGS文库建库全过程?

移液工作站

一、样本准备与初始上样
在Flex平台上,首先将提取的DNA或RNA样本放置于合适的微孔板中。利用Flex平台的多通道移液功能,准确将样本分装到建库板的指定孔位,同时自动加入相应的缓冲液和酶液,为后续反应做好准备。
平台支持自定义体积和移液速度,确保样本处理的均一性和稳定性。

二、DNA片段化与末端修复
Flex平台可自动执行DNA片段化步骤,结合物理或酶学方法,使DNA片段符合建库需求。随后进行末端修复和加A尾处理,平台精准控制试剂添加和反应时间,保证文库片段的完整性和适合后续接头连接。

三、接头连接
通过Flex平台的自动化移液和温控模块,完成接头的高效连接。系统确保反应条件的精准控制,降低接头二聚体和非特异产物的生成,提高文库质量。

四、磁珠纯化与文库洗脱
Flex平台集成磁力模块,自动完成磁珠结合、洗涤和洗脱步骤。磁珠纯化不仅能去除杂质,还能回收目标文库片段。自动化流程减少人为操作,提升纯化效率和一致性。

五、PCR扩增
Flex平台利用温控模块,自动完成PCR扩增反应。用户可设置循环数和温度梯度,确保文库获得足够的量,同时避免过度扩增带来的偏差。

六、文库质控与储存
完成扩增后,Flex平台可协助用户完成文库的体积调整和储存准备。部分流程还可对文库进行初步质控操作,为后续测序做准备。

七、软件与流程管理优势
Flex平台配套的软件界面支持全流程的自动化脚本设计和参数调整,用户无需编程即可快速设置建库流程。流程执行实时监控,确保每一步都符合预设标准,操作数据自动记录,方便追溯与优化。

使用Opentrons的Flex平台完成NGS文库建库全过程,实现了从样本分装、片段化、接头连接、磁珠纯化到PCR扩增的全自动操作。该平台不仅大幅提升实验效率和通量,还显著提高了建库的重复性和准确性,适合临床、科研及商业测序实验室。

如需了解更多Flex平台在NGS建库中的应用细节或预约产品演示,欢迎联系Opentrons技术支持团队。

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