高通量 NGS 自动化流程优化:Opentrons Flex 实例解析

随着二代测序(NGS)在科研和临床中的应用不断扩大,样本数量和检测通量持续增长,传统手工操作在效率、稳定性和可重复性方面逐渐成为瓶颈。高通量 NGS 实验对流程标准化、误差控制和人员成本提出了更高要求,自动化平台因此成为实验室升级的重要方向。Opentrons Flex 作为新一代自动化液体处理平台,在高通量 NGS 流程优化中展现出显著优势。

高通量 NGS 自动化流程优化:Opentrons Flex 实例解析

移液工作站

高通量 NGS 面临的流程挑战

在文库构建、样本归一化和加样等关键环节中,人工操作容易受到操作者经验差异和疲劳影响,导致批次间一致性不足。同时,样本量一旦提升至 96 或 384 通量,移液工作量成倍增加,不仅耗时,还增加了交叉污染和操作失误风险。这些问题直接影响测序数据质量和下游分析结果。

自动化在 NGS 流程优化中的核心价值

通过引入自动化系统,可以将重复性强、步骤标准化程度高的操作交由机器人完成,实现流程的一致性和可追溯性。自动化不仅能够显著缩短实验时间,还能降低人为误差,提高数据可靠性。在高通量 NGS 场景中,自动化已从“效率工具”转变为“质量保障工具”。

Opentrons Flex 平台的关键优势

Opentrons Flex 针对复杂实验流程进行了硬件与软件的双重优化。其高精度移液系统支持从微量到中等体积的稳定操作,适合文库构建中对体积控制要求极高的步骤。模块化设计使磁力模块、温控模块等可灵活组合,覆盖 DNA/RNA 提取、建库和纯化等多个环节。

在软件层面,Opentrons Flex 支持可视化流程设计与脚本化控制,实验人员可以根据具体 NGS 流程进行定制化优化,而无需复杂的编程背景。

Opentrons Flex 在高通量建库中的实例解析

以常见的 96 样本高通量 NGS 建库流程为例,Opentrons Flex 可将加样、混匀、磁珠纯化和洗脱等步骤整合为连续自动化流程。通过预设参数,系统能够确保每个样本在相同条件下处理,大幅降低批次差异。

在实际应用中,自动化流程可将原本需要数小时的人工操作压缩至更短时间,同时释放实验人员精力,用于实验设计和数据分析等高价值工作。

流程优化对实验室整体效率的影响

引入 Opentrons Flex 后,实验室在高通量 NGS 项目中通常能够实现更稳定的产出节奏。流程标准化减少了返工率和重复实验次数,样本周转速度明显提升。对于多项目并行运行的实验室而言,这种效率提升尤为关键。

自动化流程落地时的注意事项

在部署 Opentrons Flex 进行 NGS 自动化前,实验室需要对现有流程进行梳理,明确哪些步骤适合自动化、哪些仍需人工干预。同时,应通过小规模验证测试移液精度和流程稳定性,逐步扩大应用范围,以确保数据质量不受影响。

结语

总体来看,高通量 NGS 自动化流程优化已成为实验室提升效率和数据质量的重要手段。Opentrons Flex 凭借灵活的硬件配置和友好的软件生态,为高通量 NGS 提供了可扩展、可定制的自动化解决方案。通过合理的流程设计与参数优化,实验室不仅能够应对不断增长的样本需求,还能在标准化和可靠性方面实现质的提升。

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