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NGS(Next Generation Sequencing,次世代定序)實驗室設備是指用於高通量定序技術所需的一系列專業設備,這些設備涵蓋了從樣本處理到資料分析的整個過程。接下來的內容將介紹不同階段所需要各種實驗設備:
一、樣本處理與文庫建置設備
1.冷凍離心機:用於血液、組織等樣本的處理,如分離血漿、細胞等。
2.微量桌上型離心機:用於小體積樣本的離心處理,如DNA萃取後的純化步驟。
3.渦旋振盪器:用於混勻檢體或試劑,確保反應均勻。
4.移液器:精確轉移液體,如試劑、樣本等,確保實驗操作的準確性。
5.生物安全櫃:提供無菌操作環境,保護實驗人員及樣本免受污染。
6.核酸萃取儀:自動化萃取樣本中的核酸(如DNA、RNA),提高萃取效率和純度。
7.超音波打斷儀:用於將長鏈DNA打斷成適合定序的短片段。
8.磁力架:配合磁珠使用,進行核酸的分離純化。
二、文庫擴增與檢測設備
1.PCR儀:用於文庫建構後的PCR擴增,增加文庫中目標序列的濃度。
2、QPCR儀(即時螢光定量PCR儀):用於文庫擴增過程中的即時監測,評估擴增效果。
3、Qubit 2.0核酸定量儀:精確測量核酸濃度,為文庫建構和擴增提供重要參數。
4.超淨工作台:提供局部潔淨空間,用於文庫建置與擴增過程中的關鍵步驟。
三、定序設備
1.高通量定序儀:核心設備,用於對文庫進行定序,產生大量序列資料。常見的定序平台包括Illumina、Thermo Fisher Scientific(原Life Technologies)的Ion Torrent、Pacific Biosciences的SMRT等。
2.定序儀配套設備:如恆溫金屬浴、純水儀等,用於維持定序儀運作所需的穩定環境。
四、數據分析設備
1.高效能電腦伺服器:用於儲存、處理和分析定序產生的大量資料。
2.資料分析軟體:包含生物資訊軟體及資料庫,用於序列比對、註釋、變異檢測等資料分析工作。
五、輔助設備
1.冰箱:用於儲存試劑、樣本等,保持其穩定性和活性。
2、UPS(不間斷電源):確保實驗設備在停電情況下仍能繼續運行,保護實驗數據及設備安全。
3.可移動紫外線燈:用於實驗區域的消毒,減少污染風險。
六、自動化工作站
1.隨著技術的發展,越來越多的NGS實驗室開始引入自動化工作站,如NadAuto-16R全自動NGS工作站等。這些工作站整合了樣本處理、文庫建置、擴增、檢測等多個功能模組,能夠顯著提高實驗效率、減少人為誤差,並適應大規模定序專案的需求。
在深入探討NGS(Next-Generation Sequencing,下一代定序)實驗室的設備配置時,我們不難發現其設備體系之龐大與精密,構成了一個覆蓋從樣本精細處理直至複雜數據分析全鏈條的綜合性技術平台。這些設備不僅種類繁多,而且各自扮演著不可或缺的角色,共同推動生命科學研究的深入與精準。
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