高通量自动化技术赋能测序全流程优化
看詳情大家好,我是 Ethan,Opentrons的技術支援負責人。本期影片是我們從開箱到協議運行系列影片的第7期,上期影片我帶大家完成了吸頭長度和移液器的偏移校準,接下來我將為大家講解如何上傳和運行協議,為此,我需要準備在協議運行中要使用的所有耗材,我準備了試管架、儲液槽和96孔板,我還需要盒裝吸頭和移液器,我的右側有一個P1000 單通道移液器,左側有一個P20 8通道移液器,最後,在運行協議之前,我要先把垃圾簍放好,垃圾簍將保護金屬板免受任何在吸頭中掉落倒的液體的影響,為了在0T-2 上運行協議,我需要將我的移液器連接上OT-2,並完成甲板、吸頭長度和移液器的偏移校準。 開始之前,我需要一個協議,我已經用 Python API創建了一個用於本期視頻的協議,您可以在我們的在線協議庫中找到,協議的鏈接可以在視頻說明中查看。這是一個很簡單的協議,運行內容是從儲液槽中吸取液體分發到孔板中,我們進入應用程序,導入一個協議,我將進入 Opentrons應用程序,導航到“協議”選項卡,這一步驟帶我們進入協議導入頁面,我可以通過拖放文件到應用程序或選擇文件上傳來導入協議,我選擇選擇文件上傳選項,一個文件預覽窗口彈出,我可以選擇我已經下載好的協議,當我導入協議之後,應用程式將通過協議分析運行它,這是一個對協議進行本地模擬的過程,目的是獲取與元數據和實驗甲板佈局圖相關的特定資訊.
一旦協議被導入我就可以啟動運行,要做到這一點,我需要在協議選項卡中,然後我可以選擇3點菜單,點擊後顯示一個下拉菜單,從中選擇運行選項,所以這個列表中只有一個,如果我有多個0T-2,我選擇這台設備並點擊“進行設定”,然後就進入協議設定頁面,這個頁面提供我導入的協議的相關資訊。如果您前面幾期影片跟著我操作了,那麼您就知道我們完成了運行所需的設備校準。所以沒有必要重做第一步,如果沒完成校準,這裡會有一個黃色的警告提示需要校準,我簡要介紹一下步驟2,實驗室器具設置,Opentrons 建議將此實驗室器皿設置作為協議設置的一部分,這一步驟主要涉及使用實驗室器具位置來檢查應用或創建實驗室器具偏移,這些偏移是做小的調整,用於移液器定位到特定實驗室器具和特定實驗板位的正確位置。
由於我之前沒有在任何實驗室器皿上執行過定位檢查,我可以繼續進行步驟2,正好讓我有機會向大家展示實驗室器具定位檢查是什麼以及如何執行。讓我們繼續進行實驗室器具定位檢查吧,我一點擊開始實驗室器具定位檢查,OT-2 就會把移液器移到6號板位的A1 吸頭,我需要定位所有噴嘴與第一列對齊,當0T2 移動到吸頭架上,我需要確保所有噴嘴都處於企確的位置並對齊。如果通道沒有完全對齊,我可以點擊微調控制。我現在就開始調,因為移液通道有稍微偏離。現在微調控制將顯示出來,我要快速調整我的移液器使其對齊。
現在我要確認位置,移液管將移動到5號板位,另一根移液管將降下來到達吸頭 A1。現在我需要確保 P1000 移液管的噴嘴位於吸頭 A1 的中心,噴嘴與吸頭的頂部有一些永平方向的偏離。所以我要像之前一樣進行微調控制,稍微移動一下,一旦對齊好,我將單擊確認定位,拾起吸頭OT-2 將嘗試拾起吸頭,應用程序會問我移液器是否成功地拾起了吸頭,它已經拾起了,所以我點擊確認。它會移動到1號板位,吸頭應該位於 A1孔的中心,吸頭的底部應該與孔的頂部齊平。 我要微調它,因為它有點偏離。所以,我再次需要微調控制吸頭定位到A1孔的中心,吸頭的底部與孔槽的頂部齊平。我要確認位置,並且移液器會移動到2號板位,它將移動到儲液槽的第一列,移液器將移動到儲液槽2的A1 列中,現在我需要將吸頭對準A1列孔槽,並確保吸頭的底部與孔槽的頂部齊平。有一些偏低,所以我需要微調控制並稍微調整一下,吸頭在井 A1 孔槽居中,吸頭的底部與孔槽的頂部齊平。
所以我將確認位置並移動到3號板位,就像前兩個步驟一樣,它會移動到A1 孔槽,現在我需要確保吸頭對準A1孔位,吸頭底部與孔槽的頂部齊平。已經很不錯了,但我覺得可以更好,所以我要微調控制並稍微調整一下。現在這個校準做得非常好,到這裡我點擊確認定位,移液管將把吸頭放回5號板位的吸頭架上。它會把針頭放下,OT-2 會回到初始位置。 OT-2 復位了,說明實驗甲板定位檢查完成了。因為我的甲板地圖上都有綠色的勾選。現在在我運行的每個實驗室器具的偏移量也在這裡顯示出來了。所以我要關閉螢幕並應用實驗室器具偏移數據,在這個DEC地圖上可以看到剛校準好的實驗室器具偏移數據,現在我回到協議設定選項卡,所有校準都完成了。我可以開始運行了,我們可以點擊開始。運行啟動! 本期影片到這裡就結束了,讓 OT-2 繼續平靜地執行協議。非常感謝您收看本系列的最後一期影片。本期影片總結了讓 OT-2 執行協議所需的所有步驟,謝謝收看,再會!
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